(抗擊新冠肺炎)上海推出“病毒基因組檢測分析平臺” 疫情期間在線免費向社會開放
中新網上海1月8日電 (鄭瑩瑩)據上海科技創新資源數據中心(以下簡稱:數據中心)8日發布的消息,由該中心與中國科學院上海巴斯德研究所聯合打造的“病毒基因組檢測分析平臺”于2021年第一個工作周正式更新上線。該平臺可進行病毒基因檢測和進化分析,疫情期間面向社會提供在線免費服務。
據介紹,基因組測序是新型冠狀病毒疑似病例確診的病原學證據之一,有助疫情防控、開展各項診療。
該平臺由數據中心與中國科學院上海巴斯德研究所郝沛研究員、波蘭華沙理工大學人工智能系主任諾瓦克教授等共同研發,于2020年2月疫情期間推出,經過更新迭代,目前該平臺可同時兼容二代基因測序數據和納米孔基因測序數據,用戶只需上傳樣本數據,即可一鍵完成檢測,在1小時內得到分析結果,以助更全面地進行病毒鑒定。
上海科技創新資源數據中心副總經理李敏介紹,相比傳統的體外培養法和熒光PCR法,以及之前的二代病毒基因組鑒定與核酸檢查,新型基因測序在臨床病原微生物檢測中的檢測范圍更廣、準確率更高,而基于納米孔測序的儀器也具有便攜性強、測序速度快等優勢,可以在不同級別的醫院予以部署及使用。另外,數據中心基于遺傳進化樹研發進化分析模塊,還力求實現“發現新型病毒、鑒定傳播鏈條、發現超級傳播者和指導用藥方案”等功能。
據悉,上海科技創新資源數據中心還計劃將三代測序分析平臺下沉至社區醫院等基層醫療機構,為其提供統一的在線分析平臺服務。(完)