男性生殖器官分為內部和外部兩部分。內生殖器包括睪丸、輸精管和附屬腺；外生殖器包括陰囊和陰莖。這些器官在青春期前發育非常緩慢。進入青春期后，它們在促卵泡激素、促黃體激素和雄激素的作用下發育迅速，遠遠超過其他系統。
首次遺精
年齡平均為14～16歲，月經初潮的平均年齡比女孩晚2年左右。第一次遺精多發生在夏季。早期精液中可能沒有成熟的精子。第一次遺精發生后，身體發育逐漸緩慢，而睪丸、附睪和陰莖發育迅速，接近成人水平。青春期男性，隨著生殖器官的發育，出現毛發生長、聲音變化、喉結等第二性征。陰毛首先出現，其次是腋毛。腋毛出現一年后，長出胡須。突出的喉結是男性特有的第二性征。
陰囊
它是一個起皺的小口袋，由腹壁皮膚形成，顏色比周圍皮膚深。陰囊分為左右兩半，中間連接。左右兩半的囊中有一個睪丸和一個附睪。陰囊皮膚有彈性，表面有許多皺紋。當溫度較高時，它會松弛，皮脂腺和汗腺分泌旺盛，加速散熱；當溫度較低時，它會收縮，減少散熱，并靠近身體。陰囊的自動調節功能主要是保護睪丸的生精功能。
陰莖
它是男性的性行為器官，前端是龜頭，神經纖維豐富，是最敏感的部位。睪丸發育一年后，陰莖開始增厚，17～18歲時，它像成人一樣發育。龜頭外包裹著一層薄薄的皮膚，稱為包皮。
睪丸
是男性生殖器最重要的部分，是一對卵圓形腺體。青春期前睪丸體積僅大于嬰兒期，不足3毫升。睪丸進入青春期后發育迅速，體積可達12毫升以上。內部曲細管的長度和曲折程度增加，管腔增厚，管壁基膜上的精原細胞不斷分裂繁殖，出現各階段的精細胞，最終發育成精子。睪丸還分泌雄激素，所以睪丸既是生殖器官，也是內分泌器官。
