本報(bào)深圳8月23日電(記者嚴(yán)圣禾 通訊員趙恩汐)日前,記者從華大生命科學(xué)研究院獲悉,該院基因組多維解析技術(shù)全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合多家機(jī)構(gòu),發(fā)布了細(xì)胞組學(xué)技術(shù)Stereo-cell。這項(xiàng)技術(shù)打破了傳統(tǒng)單細(xì)胞測序技術(shù)局限,標(biāo)志著中國在細(xì)胞組學(xué)技術(shù)領(lǐng)域取得原創(chuàng)性引領(lǐng)成果——從單細(xì)胞測序往往只能獲取單一分子層面信息的“平面解析”模式邁向兼顧多模態(tài)信息、具備“立體洞察”能力,并將為規(guī)?;_展細(xì)胞病理、發(fā)育與衰老等前沿研究提供強(qiáng)有力支撐。相關(guān)成果于近日發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》。
這一成果有效避免了傳統(tǒng)方法的局限性:傳統(tǒng)的單細(xì)胞測序技術(shù)多基于液滴微流控技術(shù),易因其物理限制導(dǎo)致細(xì)胞丟失或變形問題;“納米級高精準(zhǔn)捕手”Stereo-cell以高密度DNA納米球陣列為核心,直徑僅220納米的小球以500納米的間距密集排列在芯片上,通過靜電吸附即可捕獲細(xì)胞。
該技術(shù)還結(jié)合顯微成像及空間定位,對細(xì)胞進(jìn)行“CT掃描”和“GPS定位”,能在一張密密麻麻的細(xì)胞“集體照”中精準(zhǔn)識(shí)別每個(gè)細(xì)胞,避免誤判。
更重要的是,Stereo-cell具備從百個(gè)到百萬個(gè)量級細(xì)胞投入的超寬通量范圍,能夠在一次實(shí)驗(yàn)中從大規(guī)模樣本中識(shí)別出稀有細(xì)胞亞群,即便是占比僅0.05%的稀有細(xì)胞,也能實(shí)現(xiàn)“大海撈針”。其芯片最大尺寸可達(dá)13厘米乘以13厘米,具備更大細(xì)胞通量潛能。
“一次實(shí)驗(yàn)就能捕獲百萬數(shù)量細(xì)胞,并且獲取形態(tài)、轉(zhuǎn)錄和蛋白特征,實(shí)現(xiàn)更深度地解析細(xì)胞的病理狀態(tài)。”文章共同第一作者、華大生命科學(xué)研究院劉傳宇研究員說。
除此之外,Stereo-cell支持細(xì)胞直接在芯片上培養(yǎng),實(shí)現(xiàn)原位動(dòng)態(tài)測序,捕捉基因轉(zhuǎn)錄活性變化,并保留空間位置及時(shí)序變化信息,做到細(xì)胞變化“實(shí)時(shí)直播”。
對于傳統(tǒng)技術(shù)難以處理的復(fù)雜結(jié)構(gòu)和大細(xì)胞,Stereo-cell也展現(xiàn)出獨(dú)特的優(yōu)勢。以骨骼肌纖維研究為例,Stereo-cell能精準(zhǔn)區(qū)分不同功能區(qū)域的基因表達(dá),揭示肌纖維的空間異質(zhì)性。
正如文章共同通訊作者、基因組多維解析技術(shù)全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任、華大集團(tuán)首席研究員徐訊所言:“基于此平臺(tái)發(fā)起的百億細(xì)胞聯(lián)盟,將構(gòu)建包括生命圖譜、疾病圖譜和擾動(dòng)響應(yīng)圖譜在內(nèi)的‘三大細(xì)胞宇宙數(shù)據(jù)庫’。歡迎全球科研團(tuán)隊(duì)共建共享,共同推動(dòng)細(xì)胞AI大模型與虛擬細(xì)胞系統(tǒng)研發(fā)?!?/p>




