構建人工智能框架找到最有效溶菌酶
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科技日報訊 （記者葉青）記者9月2日獲悉，廣東工業大學生物醫藥學院教授林章凜團隊與華南理工大學生物學院副教授楊曉鋒團隊合作，成功構建出一種新型的人工智能框架——DeepMineLys，并借此框架發現了迄今為止在人類微生物組中最有效的溶菌酶。近日，該研究成果發表于《細胞報告》。
“該研究利用人工智能，從人類微生物宏基因組數據中識別和挖掘出有治療耐藥菌潛力的溶菌酶，這是人工智能用于生物學研究領域的一個重要突破。”論文第一作者、華南理工大學生物科學與工程學院2018級博士生付一然說。
林章凜認為，DeepMineLys的成功得益于構建了涵蓋廣泛溶菌酶的全面訓練數據集，集成了TAPE等先進算法和編碼技術，采用了三層卷積神經網絡和雙軌架構等幾個關鍵因素，極大地提升了預測性能。
研究團隊從前100個候選溶菌酶隨機選擇了16個進行實驗驗證，其中11個被證實具有活性，最強的一個溶菌酶的活性甚至比傳統溶菌酶高出6.2倍，成為迄今為止在人類微生物組中發現的最有效的溶菌酶。“DeepMineLys不僅能夠挖掘溶菌酶，還具備挖掘蛋白質的潛力。由此可見，該框架的構建為未來生物學研究提供了一個有力的工具。”林章凜說。
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