日前，《科學(xué)》雜志刊登了瑞典科學(xué)家的重磅成果——全球首份癌癥病例圖譜“Atlas”。據(jù)悉，該圖譜將單個(gè)基因的全基因組效應(yīng)映射到腫瘤生長(zhǎng)上。 通過(guò)揭示腫瘤中的基因組改變，已經(jīng)鑒定了癌癥的分子亞型，這正在改善患者的診斷和治療。
資料圖
日前，《科學(xué)》雜志刊登了瑞典科學(xué)家的重磅成果——全球首份癌癥病例圖譜“Atlas”。據(jù)悉，該圖譜將單個(gè)基因的全基因組效應(yīng)映射到腫瘤生長(zhǎng)上。 通過(guò)揭示腫瘤中的基因組改變，已經(jīng)鑒定了癌癥的分子亞型，這正在改善患者的診斷和治療。
Uhlen等人開(kāi)發(fā)了一種基于計(jì)算機(jī)的建模方法來(lái)檢查近8000名患者的不同癌癥類(lèi)型。他們提供開(kāi)放獲取資源，探索特定基因的表達(dá)如何影響17種不同類(lèi)型癌癥患者的生存。 有超過(guò)90萬(wàn)患者生存情況可用，包括結(jié)腸癌，前列腺癌，肺癌和乳腺癌的腫瘤。 該交互式數(shù)據(jù)集還可用于產(chǎn)生個(gè)性化的患者模型，以預(yù)測(cè)代謝變化如何影響腫瘤生長(zhǎng)。
研究人員表示，該圖譜使用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和基于抗體的分析來(lái)為癌癥精密醫(yī)學(xué)提供獨(dú)立的資源。結(jié)果利用公共資源的大型系統(tǒng)生物學(xué)研究的力量，使用基因組大小的代謝模型，癌癥患者被證明具有廣泛的代謝異質(zhì)性，強(qiáng)調(diào)需要精確和個(gè)性化的藥物用于癌癥治療。
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該資源有90多萬(wàn)個(gè)Kaplan-Meier圖，可以探索影響主要癌癥臨床結(jié)局的具體基因，為進(jìn)一步深入研究納入癌癥系統(tǒng)級(jí)分析鋪平了道路。所提供的所有數(shù)據(jù)均可在交互式開(kāi)放式訪問(wèn)數(shù)據(jù)庫(kù)（www.proteinatlas.org/pathology）中獲得，以便全面探索個(gè)別蛋白質(zhì)對(duì)主要人類(lèi)癌癥臨床結(jié)局的影響。
研究人員表示，他們使用超級(jí)計(jì)算機(jī)，分析了8000種腫瘤樣本中的17種主要類(lèi)型的人類(lèi)癌癥，并使用RNA測(cè)序方法，了解基因在受癌癥影響時(shí)發(fā)生的變化，積極尋求“基因突變導(dǎo)致的基因組整體變化”。 使用基因組大小的代謝模型，我顯示癌癥患者具有廣泛的代謝異質(zhì)性，突出了精確和個(gè)性化的藥物治療癌癥的需要。 所有數(shù)據(jù)都在交互式開(kāi)放獲取數(shù)據(jù)庫(kù)（www.proteinatlas.org/pathology）中提供，以便全面探索個(gè)別蛋白質(zhì)對(duì)臨床結(jié)果的影響。
據(jù)《麻省理工技術(shù)評(píng)論》雜志官網(wǎng)等外媒報(bào)道，Atlas圖譜可開(kāi)放獲取，仍在繼續(xù)努力收集公共數(shù)據(jù)，目標(biāo)是收集可用于開(kāi)發(fā)癌癥藥物和診斷方法的實(shí)用信息，比如疾病標(biāo)志物等。（吳茜茜編譯）
